Борис Алексеевич — специалист в области механизации трудоёмких процессов горного производства, в частности — при добыче угля. В соавторстве им опубликовано более 220 научных работ, в том числе 8 монографий. Кроме того, изобретатель является автором и соавтором 120 авторских свидетельств и патентов на изобретения и полезные модели, в 64 из которых он выступил ведущим автором, а в трёх — единственным.
Основное направление научных исследований — комплексное освоение угольных месторождений при обеспечении безопасных условий ведения горных работ. Сюда входит наиболее полное извлечение полезного ископаемого (защищено 27 патентами Российской Федерации на изобретения), попутное извлечение химических элементов-примесей из угля, селективная выемка угля, использование выработанного пространства, создание техногенных месторождений полезных ископаемых.
Три технических решения, связанные с наиболее полным извлечением угля из недр и защищенные патентами Российской Федерации на изобретения, одним из соавторов которых является Борис Алексеевич Анфёров, внедрены на шахте «им. В. И. Ленина» в Кузбассе. Отметим также, что на шахте «Красногорская» при монтаже модульной котельной, работающей на дегазационном метане, было использовано техническое решение, защищенное патентом Российской Федерации на изобретение (Борис Алексеевич выступил в роли одного из ведущих соавторов). Использование этого технического решения позволило обеспечить безопасную добычу угля из дегазированных пластов.
В 1993 году за вклад в развитие угольной отрасли и в честь 10-летия основания Института угля Сибирского отделения Академии наук СССР Борис Алексеевич награжден отраслевым знаком «Шахтерская Слава» III степени. В 2002 году — «Шахтерская слава» II степени. В 2004 году изобретатель в составе творческого коллектива стал лауреатом областного конкурса «Инновации и изобретения года» (диплом II степени) за разработку технических решений по выемке угля из крутонаклонных пластов.